近日，美国贝勒医学院及太平洋西北国家实验室的科学家们利用基因组蛋白组学相结合的分析技术首次对人类结肠癌的蛋白基因组进行了详尽的分析，全面剖析了结直肠癌相关生物标志物、药物靶点和肿瘤抗原，并在Cell杂志上发表题为“Proteogenomic Analysis of Human colon Cancer Reveals New Therapeutic Opportunities”的文章。
图1.实验研究流程图
随着我国迈入老龄化社会的脚步加剧，加之人们生活方式的改变，结直肠癌发病率和死亡率正在逐年上升，为患者、家庭和社会带来了巨大的身心及经济负担。近年来，科学家们在结直肠癌基因组、转录和蛋白质组学的研究发现了许多基因组变化，并揭示了这种疾病的广泛的分子异质性，但在大量结直肠癌队列中还没有得到系统研究。该研究利用外显子组测序、基因芯片、RNA测序、microRNA测序和蛋白质组学技术，前瞻性地评估了一组结肠癌患者的组织样本（包括肿瘤组织和邻近的正常组织）的突变、拷贝数、基因表达、miRNA谱、蛋白表达和磷蛋白组水平，以寻找新的药物靶点和潜在的肿瘤标志物等。
科学家们通过分析结肠癌亚型的特征，揭示了糖酵解途径在免疫检查点抑制剂耐药性中的潜在作用，为我们对结肠癌研究提供了新的研究思路。此外，该研究发现的结肠癌相关蛋白编码基因与已知的癌症基因几乎没有重叠，有助于开发个性化疫苗以及其他治疗方法。
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