大会由福建省委副书记于广洲主持。副省长李川在会上宣读《中共福建省委、福建省人民政府关于表彰福建省第二届杰出科技人才的决定》和《福建省人民政府关于2009年度省科学技术奖励的决定》。国家科技部副部长曹健林代表科技部向大会表示祝贺并致辞。黄小晶省长代表省委、省政府向全体获奖人员表示热烈祝贺并发表讲话。获得福建省科学技术重大贡献奖的中科院院士、中科院福建物质结构研究所研究员吴新涛代表全体获奖人员发言。
大会结束后，在福建会堂广场举行了隆重的福建省第二届杰出科技人才获奖车辆发车巡游仪式。
2009年度福建省科学技术奖励共授奖244项（人）。其中，福建省科学技术重大贡献奖2人，每人奖励80万元；2009年度国家科学技术进步奖二等奖完成和参与项目8项，第一完成单位奖励30万元、参与单位奖励5万元；福建省第二届杰出科技人才30名，每人奖励一部价值30多万元克莱斯勒大捷龙商务车；2009年度福建省科学技术奖一等奖12项，每项奖励30万元；二等奖62项，每项奖励10万元；三等奖130项，每项奖励5万元。
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