2009年，省科技厅加大了科技管理改革的力度，充分发挥科技财政资金的引导作用，不断提高我省自主创新能力，实现经济与科技的紧密结合，在科研机构能力建设、科技项目监管、科技成果向现实生产力的转化等方面采取有力措施并取得了好的效果。
一是加强了科研机构的创新能力建设。本着突出重点、示范带动、扶优扶强、持续培育的原则，加大了对科研机构扶持力度，重点支持了转制科研机构的创新人才团队、科技创新服务能力建设。全年共投入6100万元对贵州省冶金设计院等15个科研院所的创新能力建设进行了重点支持，比去年资助资金增加4660万元。对建立以贵州省应用工程技术研究院为主体，行业技术创新体系为支撑的区域科技创新体系进行调研，并提出了全省科技资源整合初步方案。
二是加强了科技计划管理和项目监管。注重各类计划项目的衔接，基本形成了应用基础研究、攻关、系统集成、成果应用转化、平台团队建设等的有机结合。完善和落实科技计划项目管理与评审的相关制度，最大限度地发挥财政资金的导向作用。通过制定并实施《贵州省重大科技专项经费预算评审（试行）办法》，对重大专项申报资金进行了评审，审减专项经费425.40万元,审减率达22.73％。通过邀请云南、重庆等省外专家参与项目网上评审，探索了科技项目立项更加公正和公平的路子，逐步改变了以往科技项目的评审依靠省内专家的做法。开展了茅台基金项目在全国进行招标的试点工作，吸引了一批省外优秀创新人团队，为有效引进高层次科技人才打开了通道。同时，为加强项目和资金的管理，制定并实施了《贵州省科研机构创新能力建设专项资金管理办法（暂行）》等四个办法。
三是加强了产学研紧密结合，通过整合科技资源，积极探索建立产业技术创新战略联盟。依托瓮福（集团）有限责任公司，整合了省内外近20家科研机构、高等院校，成立了我省首个产业技术创新战略联盟--"贵州省磷化工产业技术创新战略联盟"；依托"国家复合改性聚合物材料工程技术研究中心"，在高分子领域开展了构建水处理膜材料、微孔发泡材料、聚氯乙烯材料三个产业技术创新联盟前期工作。同时，充分发挥财政资金的导向作用，重点支持产学研合作项目，推动了以企业为主体、市场为导向、产学研相结合的技术创新体系的建立。全年全省科技重大专项重点项目全面实行产学研合作，投入项目资金2355万元，占省财政投入10%。
