在“合作创新、加强转化、重点突破、引领跨越”的科技发展方针指引下，2009年全省科技工作积极融入国家战略，按照“上争、外引、内聚”的思路，推动有效机制建设，使合作创新迈上了新台阶，为整合科技资源、增强创新能力争取到了重要机遇。
一、积极争取科技部与省政府建立了部省工作会商机制
为进一步集成中央和地方科技资源，部省联动共同打造具有贵州特色的区域创新体系，省科技厅积极与科技部沟通，促成科技部与省政府于7月6日在贵阳举行了第一次部省工作会商会议，全国政协副主席、科技部部长万钢和省长林树森分别代表科技部和省政府签订了部省工作会商议定书，这是省政府与国家部委建立的第一个省部合作机制。省部双方决定未来几年将集中力量，围绕喀斯特石漠化生态脆弱区可持续发展、壮大贵州特色产业支撑经济社会发展、推动军民结合创新体系建设促进传统优势产业的改造和提升、创新体制机制推动创新环境建设四个方面开展合作创新。
全年科技部围绕会商主题，在工程技术研究中心建设、特色产业发展等领域立项资助我省科技项目240项，资助金额达1.66亿元。在研发平台建设上，批准组建了以江南航天集团林泉电机厂为依托建设的“国家精密微特电机工程技术研究中心”，这是继国家复合改性聚合物材料工程技术研究中心挂牌成立后，我省获准建设的第2个国家工程技术研究中心，也将成为我省第一家以企业为依托的国家级工程技术研究中心，对全省以企业为主体的自主创新体系建设具有开创性意义。在壮大特色产业、支撑经济社会发展上，将“半夏、何首乌、金钗石斛等8种药材规范化种植和野生保护抚育关键技术研究及应用示范”纳入国家科技支撑计划，资助资金2800万元；支持我省国家中小企业创新基金项目50项，资助资金3090万元；将长顺县、贞丰县、修文县、桐梓县、三穗县、道真县、湄潭县等7县列入国家科技富民强县工程专项，资助资金1140万元；将“贵州液态奶加工关键技术熟化与转化”等11个项目列入国家农业科技成果转化资金项目，资助资金700万元。这些项目的实施对推动我省特色优势产业发展，壮大县域经济将起到重要作用。在国际科技合作交流上，将“定向/单晶涡轮叶片陶瓷型芯关键技术研究”等3个项目列入国家国际科技合作计划，资助资金718万元；认定贵阳医学院和贵州科学院为国家国际科技合作基地；在毕节建立了农村科技合作交流中心，为推动我省基层参与对外科技合作交流格局的建立提供了重要平台。此外，为进一步推动我省科技与金融良性互动发展，科技部还决定在科技风险投资领域对我省提供国家创业投资引导基金阶段参股支持。
围绕部省会商确定的科技创新体制、机制改革，省科技厅还进行了大胆探索，成立了“贵州省磷化工产业技术创新战略联盟”、“贵州省茶产业技术创新战略联盟”2个产业技术创新战略联盟，为进一步加强产学研合作机制、依靠科技创新解决行业关键共性技术瓶颈问题创造了条件。
二、积极推动中科院与省政府确定了全面战略合作规划
我省是与中科院最早开展科技合作的省区之一。2004年省政府与中科院签订了第二轮科技合作协议，双方决定自2005年起实施为期三年的“科技支黔”工程，为贵州产业发展、科技创新、人才培养提供科技援助。近几年，省科技厅积极配合中科院实施“科技支黔”一期工程并取得了明显成效，中科院决定自2009年起继续实施二期“科技支黔”工程。为更有效实施二期“科技支黔”工程，进一步拓宽合作领域、深化合作内容，省科技厅与中科院针对全省经济社会发展科技需求开展了相关调研，形成了《贵州省产业科技需求调研报告》，并以此为基础与中科院共同研究起草了《中国科学院贵州省人民政府全面战略合作规划纲要（2009-2015）》。在积极向省政府汇报并与中科院充分协调沟通后，2009年8月18日，中科院与省政府在贵阳举行了全面战略合作座谈会，林树森省长和白春礼常务副院长出席了座谈会，双方共同审定了《中国科学院贵州省人民政府全面战略合作规划纲要（2009-2015）》。确定今后一段时期围绕贵州区域经济社会发展重点需求，开展煤炭清洁转化与增值利用技术、传统优势产业技术改造升级、新兴产业培育发展、农牧业与生态环境协调发展、共建可持续发展区域创新体系领域的技术合作研发与推广工作。
围绕喀斯特石漠化治理，中科院已将普定岩溶观测站纳入该院“十二五”平台建设计划，前期投入资金300万元，2010年还将继续投入2000万元。结合野外台站建设，中科院还将组织有关专家于近期开展生态恢复示范区论证工作，为我省喀斯特石漠化治理提供技术支撑。省科技厅也充分利用这一院省合作创新平台，整合省内相关资源与中科院开展科技合作。针对FAST项目建设关键技术问题，整合全省优势资源组成贵州省FAST轻型结构攻关团队，与国家天文台等部门合作，开展FAST轻型结构优化设计与试验，为FAST项目建设提供支持，为全省新兴材料产业发展创造条件；促成贵州建新南海科技股份有限公司等24个单位200多名科技人员，与中科院沈阳自动化所等中科院系统相关院所建立了合作关系。
此外，省科技厅立足全省经济社会发展需求，开拓思路，创新工作方式，积极推动省际、省地（校）科技合作。我省部分地方政府（企业）与上海市、陕西省相关部门签订了省际科技合作协议，省科技厅与安顺市等4个市（州、地）政府、贵州师范大学等4所高校签订了8个省地（校）科技合作协议。通过项目合作，用2150万元财政合作资金拉动社会科技投入4450万元，合作资金杠杆效应初步显现。
此外，省科技厅立足全省经济社会发展需求，开拓思路，创新工作方式，积极推动省际、省地（校）科技合作。我省部分地方政府（企业）与上海市、陕西省相关部门签订了省际科技合作协议，省科技厅与安顺市等4个市（州、地）政府、贵州师范大学等4所高校签订了8个省地（校）科技合作协议。通过项目合作，用2150万元财政合作资金拉动社会科技投入4450万元，合作资金杠杆效应初步显现。
