省部共建青稞和牦牛种质资源与遗传改良国家重点实验室(以下简称“实验室”)自2016年科技部批复建立以来，实验室瞄准青稞和牦牛产业发展重大技术创新需求强化科研攻关，经过5年的建设运行，实验室在提升青稞牦牛基础研究水平、人才团队建设及实验室管理运行方面取得了显著成效。在青稞基因组学、青稞高原适应性、青稞新品种选育、青稞绿色增产、牦牛资源挖掘、物理图谱构建、牦牛健康养殖等方面自主创新能力持续提升、优势持续强化，取得了一批重要成果。
在青稞方面首次完成了青稞基因组框架图，提升了青稞研究基础水平。5年来累计收集保存青稞种质2429份，建立了300份青稞种质资源表型数据库，构建了200份育种动态核心基因库，筛选出优质种质142份，为创制高产、高秆青稞新种质奠定了基础。创建了青稞双高协调选择育种技术体系，培育出了“藏青16”“藏青17”“藏青18”“藏青20”“冬青18号”“冬青19号”等青稞新品种6个，其中“冬青18号”成为自治区冬青稞主栽品种，青稞新品系“13-5171-7”有望成为下一代西藏青稞主推品种。
在牦牛方面摸清了西藏牦牛遗传多样性显著，解决了西藏牦牛遗传进化迁徙问题;构建了牦牛精细物理图谱，研制了牦牛基因芯片，建立了牦牛基因组学数据库;构建了牦牛特异性基因、甲基化和蛋白网络图谱，绘制了多网络图谱;牦牛种质资源研究取得重大进展，“类乌齐牦牛”成为国家级牦牛遗传资源;持续推进娘亚、斯布、帕里、果扎、查吾拉等五个牦牛选育基地的本品种牦牛选育工作;明确了高寒草地合理放牧强度和方式，研制并集成了牦牛繁育与健康养殖技术，加强了西藏高原畜牧业提质增效的科技基础。
5年来，实验室作为课题或子课题主持单位共参与国家重点研发7项，发起主持国家自然科学基金联合基金重点项目1项，主持国家自然科学基金4项，重大国际合作项目1项。共发表SCI收录论文42篇，其中以第一作者单位或通讯作者单位在Nature Communications、MP等影响因子超过5以上刊物发表论文12篇，影响因子9以上刊物发表论文2篇。共获得省部级及以上科技奖励8项，其中以第一完成单位获西藏自治区科技进步奖2项，二等奖2项，三等奖2项。
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