“市旗共建”是呼伦贝尔市科学技术局与各旗市区政府共同围绕本地区县域创新发展需求，就科技重点工作深入协商、形成共识、集聚资源、合力推进的工作机制。双方将本着“突出重点，集成资源，各方互动，共同参与，注重实效，驱动发展”的原则，围绕各地区经济社会发展实际，凝炼共性目标和工作重点，集成呼伦贝尔各类创新资源，找准工作切入点和突破口，充分发挥总体推动和协调作用及区域的示范带动效应，结合区域发展实际因势利导，因地制宜，点面结合，分类指导，合力推进，实现区域创新发展。
“市旗共建”重点内容一是围绕市旗双方共同关注的科技需求，凝练重大科技项目，积极组织申报国家级、自治区级科技重大专项，争取项目资金支持；二是围绕落实市委市政府重大决策部署，推进“科技兴蒙”行动落实，围绕自治区“4+8+N”合作机制，组织与大院大所开展科技合作，为企业和科研机构搭建技术引进和成果转移转化平台；三是围绕创新平台载体重塑重构和能力提升，协同推进创建国家级、自治区级各类科技创新平台载体。四是围绕重点领域人才需求，共同推动需求和人才精准对接，着力引进、培养一批具有发展潜力的科技领军人才和高层次创新创业团队。
通过市旗共建上下联动，将充分发掘各地区资源优势，以科技重点工作和科技项目为抓手，组织实施一批重点科技项目，着力推进重大关键技术攻关，加快科技成果转移转化，充分释放县域创新发展的巨大潜力和强大动能，让科技创新为县域经济高质量发展提供有力支撑。
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