随着生命科学领域研究的深入和技术的发展，科学研究和临床诊断逐渐向基因水平聚焦，全基因组测序技术已开始成为这些领域重要的研究手段。日前，由上海科技创新资源数据中心研发，基于PaaS的在线生物信息分析平台G-Xpert已基本完成，预计于今年年底全面上线。
过去，基因测序技术受地域限制和分析周期的影响，分析结果的及时性较弱，尤其是对疾病的快速诊断十分不利。基于云计算的生物信息分析平台，则可以打破测序数据分析的专业壁垒，满足不同研究领域用户的需求。例如，一名从事细菌进化研究的科研工作者，可以在平台上完成测序数据质控、变异位点提取、进化树构建等常规分析步骤；一名从事肿瘤研究的临床医生，在平台上可以完成肿瘤组织与正常组织的突变比对，从而获得肿瘤独有的变异位点。
数据中心首席技术官张嘉锐告诉记者，在线生物信息分析平台，通过部署各领域专家背书的分析流程以及PaaS级别的定向优化，大大降低使用门槛，使科研人员和医务工作者提高研究效率，实现“数据不落地”的在线协同。据介绍，今年疫情期间，数据中心推出的病毒基因组检测服务，就是该生信分析平台的主要功能之一，用户只需上传呼吸道样本的二代测序数据，即可在3小时内检测出是否含有新型冠状病毒。
未来，数据中心还将根据业务实际需求，除了在线分析外，将对于医院、疾控中心等涉及敏感数据的机构，协助完成本地化部署检测流程和云平台，提升实时检测的能力。（记者 马亚宁）
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