2011年7月，青海省人民政府与中国工程院签署了科技合作协议，协议内容的第一条就是“开展重大决策咨询”。为落实协议精神，中国工程院成立了“三江源生态补偿机制研究”项目办公室，将实施该项目作为落实该项协议的一项重要内容，拟向国务院提出重大建议。 该项目由不同学科及专业背景的院士专家为核心组成研究队伍，通过专项调研及专家咨询等方式，对三江源现有的生态补偿机制、方式、途径等开展研究，提出制约三江源生态补偿实施效果的关键因素与解决途径，为实现我国生态保护区民族生态保护与经济协调发展提出战略性的建议。中国工程院院长周济院士指出“这个项目很重要，既有特殊的重要性，又有普遍的战略意义”。 为启动该项目，受中国工程院委托，中国环境科学研究院和青海省科技厅于2011年10月15日在中科院高原生物研究所召开了“三江源生态补偿现状与问题”咨询研讨会。会后，专家组成员深入到黄南州同仁县、泽库县、同德县以及海南州贵德县进行了调研，考察了退牧还草、禁牧减畜、生态移民、荒漠化治理、草原建设等生态工程，初步掌握了三江源生态补偿现状与主要问题的第一手资料，为下一步工作打下了基础。 该项目由中国工程院院长周济担任顾问，项目成员包括了相关领域的20多名院士专家。该项目实施启动会拟于2011年12月上旬在北京举行，将邀请相关院士专家对三江源生态补偿现状与问题进行深入分析，汇报第一次调研的成果，进一步落实各项工作任务。该项目预计2012年8月完成，最终将向国务院提交《三江源补偿长效机制重大建议》报告。
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