幽门螺杆菌是人类最常见的慢性感染细菌，全球约半数人口感染幽门螺杆菌，70%以上的胃癌与幽门螺杆菌感染有关。中科院青岛生物能源与过程研究所、中国疾病预防控制中心传染病预防控制所（中国疾控中心传染病所）、青岛市立医院、青岛星赛生物等单位研究人员组成的联合团队，依托原创的临床单细胞拉曼药敏快检系统（CAST-R），建立了单个细菌细胞精度、“鉴定—药敏—溯源”全流程一体化的幽门螺杆菌诊疗技术——CAST-R-HP，具有快速病原鉴定、精确药敏表型检测、基于单细胞全基因组支撑耐药机制研究与精准溯源等优势。相关研究成果近日发表于《临床化学》。
目前幽门螺杆菌耐药菌鉴定的临床金标准是内镜检查与细菌培养相结合的药敏检验。由于其生长条件苛刻，分离和培养胃活检标本中的幽门螺杆菌通常需7~10天，且难以考察临床样品中“原位”的病原多样性。表型药敏实验同样耗时很长，且技术要求高。而基于基因型的药敏检测方法仅能预测部分已知耐药基因的突变，并存在不同程度的假阴性。目前临床医生主要依赖经验用药而非药敏结果指导下的精准治疗。但是，随着幽门螺杆菌耐药性的不断增加，经验治疗的根除失败率日益严重。
利用CAST-R-HP，从临床样品到药敏结果的完整诊疗流程可缩短至3天，而且能在单细胞分辨率、全基因组水平完成耐药机制研究与精准溯源。
下一步，研究人员将基于“微生物药敏单细胞技术临床示范网络”开发CAST-R-HP系统，拓展其应用，为建立单细胞精度的幽门螺杆菌诊疗与疾控体系奠定技术和装备基础。（廖洋 刘佳）
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