根据2013年9月通过的《俄罗斯科学院改革法案》，俄政府成立了联邦科研机构管理署负责由原俄科院、俄医科院和俄农科院支配的联邦资产及下属所有机构的管理工作。目前，俄联邦科研机构管理署全部机构和人员已经基本到位。管理署领导层包括：署长科丘科夫，副署长梅德韦杰夫，两位署长助理分别为奥金佐夫和斯捷潘诺夫，两位署长顾问分别为奇卡诺夫和朵库恰耶娃。
管理署下设18个局，分别为：
1. 与俄科院配合及保障科学协调委员会工作局，局长暂缺，副局长斯捷潘诺娃；
2. 方法、计划与项目局，局长切尔内舍娃；
3. 科学类机构工作协调和保障局，局长罗曼诺夫斯基；
4. 医学科学、卫生、教育及文化类机构工作协调和保障局，局长冈察洛夫；
5. 农业类机构工作协调和保障局，局长巴吉罗夫；
6. 预算投资局，局长伊万诺夫；
7. 联邦资产局，局长罗曼年柯；
8. 联邦资产产权和土地关系登记监督局，局长苏尔特戈夫；
9. 财务局，局长暂缺，副局长塔拉索娃；
10. 经济规划局，局长布尔托利科娃；
11. 会计统计局，局长兼总会计师库兹明；
12. 战略发展和外联局，局长、副局长均暂缺；
13. 信息技术和信息保护局，局长、副局长均暂缺；
14. 评估分析局，局长阿克谢诺娃；
15. 机关事务管理局，局长暂缺，副局长梅尔尼科娃；
16. 内部财务监督和审计局，局长彼得罗夫；
17. 法规局，局长波利亚科娃；
18. 行政管理局，局长暂缺，副局长舍霍丹诺娃。
另外，俄联邦科研机构管理署官方网站于2014年3月31日开通，网址为：www.fano.gov.ru。
网站将公布俄联邦科研机构管理署的全部信息和最新活动。主页最中间部分是消息板块，用于发布国内外科技领域最新信息。通过“管理署简介”板块，访问者可了解联邦科研机构管理署的组织结构、下属科研机构清单以及最近工作安排。“法规文件”板块则用于刊登指导管理署工作的所有官方法律法规。网站还设置了“新闻中心”板块，公布管理署活动、新闻及反映管理署领导会见、访问、演讲等活动的视频和照片等内容。
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