菌种是食用菌产业发展的“芯片”。房县按照种业振兴有关部署，重点在区域性品种选育、供种能力提升、良种示范推广等方面开展种业创新，加快推进食用菌良种繁育基地建设，为促进食用菌产业高质量发展提供“芯”支撑。
一是突出科技赋能。积极与上海市农科院、华中农业大学、湖北省农科院等院校加强产学研合作，加快推进区域性优良菌种选育、高效栽培技术集成示范推广等工作。支持湖北菌香源生物科技有限公司，建立了国家食用菌产业技术体系首席科学家谭琦牵头的专家工作站。依托华中农业大学，成立房县农业特色产业研究院食用菌研究中心，安排专项资金，在沙河乡建立集食用菌新品种引进、选育、示范推广为一体的试验示范基地。目前，从上海市农科院首批引入的沪农1号、沪农4号、215、F2香菇品种，从外地、本地收集的11个香菇木耳品种已进入试验栽培阶段。
二是提升供种能力。统筹香菇优势产业集群项目资金、对口协作项目资金及县产业链扶持资金1500多万元，支持菌香源菌业、天禾菌业2家菌种企业扩建增容，建设菌种研发中心，目前2家企业已完成项目建设并投入使用，共新建菌种净化生产车间8000平方米、购置机械设备60余台套，全县固体菌种生产能力达到450万公斤、液体菌种生产能力达到50万升，菌种在满足本县生产需求的同时，销往十堰、襄阳、随州等地。
三是加强示范推广。在全县示范、推广食用菌品种20多个，其中段木黑木耳主推261、939品种，段木香菇主推507品种，代料黑木耳主推大山黑、黑3品种，代料香菇主推135、农香6号、农香8号品种，羊肚菌主推六妹、七妹系列品种，全县培育形成食用菌重点乡镇9个、专业村22个，发展代料食用菌5800万袋、段木黑木耳10万架、段木香菇200万筒、羊肚菌1.02万亩。
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