围绕创新合作、协同发展，南京市持续深化校地合作，通过资源统筹、优势互补，推动高校与地区发展深度融合，大力促进科技创新和科技成果转化。
一是依托大院大所布局重大创新平台。与在宁高校院所建立常态化协作机制，依托高校院所学科资源、人才资源优势，布局建设网络通信与安全紫金山实验室、扬子江生态文明创新中心、紫东现代综合交通实验室、未来食品领域类国家技术创新中心等国家重大创新平台。
二是依托驻点对接拓展市外高校合作。实施“百校对接计划”，遴选“创新大使”赴全国各重点高校院所开展驻点对接，推动南京市与市外高校院所开展产学研合作。截至目前累计建设校地、校企合作联盟和实习基地57个，共选派105名“创新大使”，覆盖全国19个省（直辖市）、22个城市和68所重点高校院所。已引落新研机构49个，引进高层次人才（团队）近400人，落地转化科技成果210多项。
三是依托高校资源共建高校“创新港”。以本市高校院所优势专业为支撑，结合所在城区主导产业定位，校地双方共建“校区、园区、社区”三位一体的国际“创新港”。目前已与南京理工大学、南京航空航天大学签订共建创新港框架协议，并分步推进建设南京理工大学长三角智能制造创新港和南京航空航天大学国际创新港。四是依托制度创新促进地方产业转型升级。充分利用省科技镇长团工作平台，发挥高校高层次人才优势，加快高校科技成果转化和地方产业转型升级。截至目前全市累计接收11批科技镇长团共计721人，促成校地、校企签订2000多份合作协议，助推近100家企业成功上市。
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