胃癌是我国高发的恶性肿瘤之一，晚期胃癌患者五年生存率不足5%。临床上治疗胃癌的一线用药多为广谱抗癌药，造成化疗毒副作用大、疗效不明显。2013年，北京市科委在“生命科学领域前沿技术培育”专项中设立“基于蛋白质组学的胃癌个体化治疗技术研究”课题，日前取得了重要进展，胃癌蛋白质组全套检测时间缩短至1天，达到国际领先水平。
该研究由北京蛋白质组研究中心牵头，联合301医院、307医院等，将国际前沿的蛋白质组学技术应用到临床诊断领域，开展胃癌的个体化诊疗研究。课题组利用蛋白质组学和生物大数据手段，建立了标准化、高效、高精度的临床个体化医疗蛋白质组学技术策略，可以在1天内完成一个胃癌病例的癌组织、癌旁组织蛋白质组的全套检测，而国际上其他技术策略达到此覆盖度和精度需要三周，达到国际领先水平。
此外，课题组通过对100例胃癌病例的癌及癌旁蛋白质组的检测及数据分析，确定了胃癌的特征性蛋白质谱，这套蛋白质谱数据可为胃癌的预警、预防、诊断和治疗提供科学依据。同时，根据对大量病例数据的分析，首次提出可以通过对胃癌病例的转录因子扫描建立驱动性转录因子胃癌模型。利用该模型可有效地区分胃癌恶性化等级，有望根据分级、分型开展针对性地治疗，对胃癌个体化治疗具有指导性意义，为临床肿瘤分子分型、精准医疗开拓光明的前景。
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