设立合芜蚌自主创新综合试验区是省委、省政府加快安徽崛起的重大决策，蚌埠市委、市政府抢抓机遇，积极谋划，以提高创新能力为核心，以培育创新主体为重点，以壮大创新型产业为目标，积极探索推进自主创新的有效途径和体制机制，激发全社会自主创新积极性，以促进全市经济争先进位、升级提速。试验区建设工作启动以来，按照“两个突破、两个提高、四个翻番”的总体建设目标，围绕提高创新能力、完善创新体系、培育创新主体、壮大新兴产业等方面，蚌埠市扎实推进试验区建设。
一是创新能力逐步增强。围绕光伏、生物等创新型产业发展，先后攻克国家一类新药盐酸安妥沙星、柠檬酸联产木糖醇、微晶硅太阳能薄膜电池生产等一批技术难题，为产业发展提供科技成果支撑。“浮法玻璃工程技术优化集成及关键设备国产化”获部级科技进步一等奖；全市专利申请量2009年首次突破千件大关，达到1202件，同比增长119%，为全省平均增幅的2倍。
二是创新体系日趋完善。国家专利技术展示交易中心、国家精细化工创新基地公共服务平台、“科技路路通”蚌埠分中心等多个公共服务平台陆续投入使用。浮法玻璃新技术国家重点实验室、国家生物发酵工程技术研发服务平台等获批建设，新建省级工程（技术）研究中心、企业技术中心等21个省级以上研发平台。上海理工大学国家大学科技园蚌埠基地主体建成使用，并被认定为国家级科技企业孵化器；国家玻璃新材料高新技术产业化基地、安徽省汽车零部件高新技术产业化基地顺利通过认定；大学科技园开工建设，省级留学人员创业园即将正式挂牌。
三是创新主体不断壮大。2009年，蚌埠市中电41所、普乐新能源等24家企业通过国家高新技术企业认定，新增数量居全省第三位，目前全市高新技术企业总量已达50家，高新技术产品达55个。丰原集团、昊方公司被认定为国家级创新型（试点）企业，玻璃工业设计研究院、金威公司等5家企业被认定为省级创新型（试点）企业，总量居全省第三位。
四是产业结构不断优化。围绕新兴产业发展和传统产业升级重点实施了一批产业化项目，三鑫公司120万重量箱超白太阳能玻璃、普乐公司50兆瓦薄膜太阳能电池、丰原集团万吨级秸秆综合利用、柳工5000台汽车起重机一期、配天机电微波射频器、华益公司AR抗反射镀膜玻璃等项目已正式投产，200吨碳纤维及500吨原丝技术改造项目获得重启，200台大型数控机床、合众有机硅等项目进展顺利。2009年，六大产业完成投资108亿元，六大产业规模以上企业实现产值294.2亿元；全市规模以上高新技术产业实现产值224.4亿元，同比增长24%，实现增加值61.5亿元，同比增长30.2%，高于全省平均水平5.3个百分点。
