桐城市以科技成果转化推广为主线，不断加大科技创新投入力度，企业自主创新能力显著提升。全市高新技术产品已达21项，高新技术产业实现产值23.5亿元，获得专利授权188件，56家企业通过了ISO9000系列质量体系认证，17家企业凭借科技创新，占据全省200强企业的近十分之一，全市经济发展实现了可持续增长。
加大资金投入。该市一方面充分发挥财政投入的引导作用，扶持和奖励有自主知识产权、产业关联度大、附加值和市场份额高的重要技改项目和科技创新平台建设。去年全市技术研发经费达1805万元。另一方面，充分发挥企业投入的主体作用。为鼓励企业自主创新，该市严格执行国家“加计扣除”和高新技术企业优惠政策，逐步形成了“投入—创新—发展—再投入—再创新—再发展”的良性循环。2009年，全市规模以上工业企业技术开发、技术引进、成果转化经费支出占产品销售收入的4.3%，累计实施各类技术创新项目1000余项，投入经费12亿元。国家高新技术企业——华祥集团2009年的科技投入达2100万元，占公司销售收入的7.8%。科技投入带来了丰硕的成果，该公司开发的气缸套、铝活塞等十大系列所有型号的产品，获国家专利5项，产品远销十几个国家和地区。
科技创新，人才是根本，该市先后出台了《桐城市人才招聘管理办法》和《民营企业科技人员管理办法》，营造有利于吸引人才、留住人才、用好人才的环境，坚持培养本地人才与引进外来人才并重，以委培、参训、进修、聘请、引进等方式，培养了900多名高级技术和管理人才。目前，该市拥有专业技术人员1.77万人，每万人拥有专业人员数236人。
产学研结合，促进自主知识创新。突出企业的自主创新，政府通过各种形式，一方面加强企业和科学院所的“自由联姻”，加快科研院所科研成果的实际应用；另一方面，由企业根据产品“下订单”，积极与在某一领域有较强科研能力的高等院校、科研院所合作，促进企业产品的科技含量。安徽天元食品公司与南京农业大学、合肥工业大学合作，将现代食品加工技术应用到传统鸭蛋的规模生产中，缩短了生产周期，提高了蛋鸭的产量和质量，其保健蛋生产新技术项目被列入了省十一五科技攻关计划。
