为落实省委省政府自主创新战略，着力实现创新发展、转型发展，滁州经济技术开发区结合实际，按照“营造创新创业环境，集聚科技创新资源，提升自主创新能力，培育自主创新产业，辐射带动区域发展”的发展思路，明确工作目标，制定工作措施，采取多种形式，实施科技创新，全力推进自主创新工作，推动园区转型升级。“十二五”期间滁州经开区力争高新技术企业数、创新型企业数、专利授权量实现年均倍增，“十二五”末高新技术产业产值占工业总产值比重超过80%，科研活动经费支出占GDP的比重超过5%，成为泛长三角新兴的先进制造业和现代服务业集聚区，滁州经济第一增长极。
一是积极创建省级高新技术开发区，制定创建行动方案，以建设高新技术产业发展先导区、承接长三角家电及模具制造业桥头堡、新能源与节能环保新材料等新兴产业发展基地为战略定位，高起点规划，成立高规格专门工作机构，积极参与创新型园区创建。
二是制定《滁州经济技术开发区转型升级鼓励企业自主创新暂行办法》，设立2000万元的自主创新专项基金，对企业自主创新予以奖励。办法规定：对新认定的高新技术企业，除享受国家税收优惠政策外，给予一次性50万元奖励；对新认定制国家级工程技术研究中心，企业技术中心，工程实验室、重点实验检测中心和博士后工作站，给予一次性50-100万元奖励；对具备上市条件的园区外企业，将企业总部迁至开发区注册上市的，一次性奖励1000万元；对在境外成功上市的开发区企业，视企业业绩，一次性给予500-1000万元奖励；对引进开发区工作并定居的两院院士、国家级专家、省级专家，分别发放安家补助费30万元、20万元、15万元，发放生活补贴1万元/月，6000元/月，3000元/月。
三是加快科技服务平台建设，加大服务企业力度。开工建设中国家电研究院滁州分院，筹建中国家电装备制造工程研究院滁州分院，引进复旦大学柔性显示器等高科技项目入园孵化。面向园区企业组织品牌建设、高新技术企业和产品认定、知识产权保护、各类计划项目申报、自主创新税收政策、企业技术中心和新产品申报等培训和辅导。对8家企业科技创新进行表彰重奖。
