2010年12月，科技部、人民银行、银监会、证监会、保监会联合下发了《关于印发促进科技和金融结合试点实施方案的通知》,提出要依托国家高新区、国家自主创新示范区、国家技术创新工程试点省（市）、创新型试点城市，探索科技资源和金融资源对接的新机制和新模式，加快建立多元化、多渠道、多层次科技投融资体系，突破企业融资瓶颈，促进科技成果转化，培育和发展战略性新兴产业。《通知》指出：支持和推动科技型中小企业开展股份制改造，完善非上市公司股份公开转让的制度设计，支持具备条件的国家高新区内非上市股份公司进入代办系统进行股份公开转让。
为推动“新三板”工作的顺利开展，吸引更多的企业积极参与，争取早日进入“新三板”试点园区，合肥高新区成立了新三板推进工作领导小组，积极协调省、市主管部门联合出台补助政策，推动合肥高新区科技型中小企业开展股份制改造，推进高新区内非上市股份公司进入证券公司代办股份转让系统（“新三板”）试点工作。今年以来已经先后多次召开“新三板”动员会及培训会，并多次陪同券商走访企业，宣传“新三板”政策，让更多的企业了解“新三板”。 3月10日，管委会邀请西部证券、长江证券、东方证券等多家知名券商为园区企业进行“新三板”培训，安联科技、六方深冷等约70家企业负责人积极参会，整个会场座无虚席。
“新三板”市场有别于主板和创业板，主要是为非上市有限公司的股份提供有序的转让平台，有利于提高股份的流动性，完善企业的资本结构，提高企业自身抗风险的能力，增强企业的发展后劲；可以促进挂牌企业较快转到中小企业板和主板，是中小板和创业板市场的蓄水池和孵化器。高新区具备申报条件的企业160余家， 14家企业与券商签订了“新三板”协议，其中，完成中国证券业协会预备案的企业2家；完成内核2家，完成股改企业5家，正在进行股改5家。此外还有70余家区内高新技术企业有意进入“新三板”。
截至目前，合肥高新区 “新三板”试点申报工作进展有序，并得到省市有关部门的大力支持，有望继中关村之后率先跻身全国第二批“新三板”试点园区。
