萧县坚持实施科技兴牧工程，用工业化的理念发展畜牧业，把先进实用的技术应用到动物疫病防治、畜禽品种改良、饲草饲料、畜产品加工和名优特新产品开发等方面的各个环节，采取技术培训、技术咨询、技术引进等措施，积极组织广大畜牧科技工作者学科技、用科技，为畜牧业发展提供强有力的技术支持，初步形成了以专业技术队伍为依托、企业为主体的畜牧业科技创新体系。全县去年肉类总产12.83万吨，禽蛋总产7万吨，奶类总产0.65万吨，畜牧产值35.2亿元，创历史新高。
萧县是畜牧养殖大县，畜禽存栏总量达1400万头。按照“龙头+基地+农户”的发展模式，积极培育畜牧龙头企业，加快畜牧产业化经营，形成了产加销一条龙、贸工牧一体化的产业化格局。目前已拥有省级龙头企业1家，市级龙头企业19家。在这些龙头企业带动下，畜牧生产快速发展，去年畜禽出栏总量达1161万头。萧县还充分利用现有龙头企业和优势产品，拉长产业链条，建立畜禽产品生产、加工、销售产业链，形成了以生猪、家禽、肉羊、肉牛、奶牛为主的五大产业。标准化养殖小区（场）165个，其中省级3个、市级20个、县级142个，规模养殖比重62 %。
