科技创新是工业经济转型升级的根本动力。近年来，阜阳市坚持把科技创新放在工业转型升级的核心位置，围绕产业技术创新升级，聚资源、育主体、建平台、强投入、增后劲，不断加大工业经济创新发展力度，促进了工业快速发展。2015年全市规模工业增加值突破500亿元，达到503.5亿，增长10.8%，总量居全省第7位，增幅居全省第4位。
一是工业企业研发投入占据全社会研发投入主导地位。工业企业科技创新活动显著增强，2015年规模以上工业企业达到1400家，比上年增加 200家，其中有R&D活动企业超过100家，有科研机构企业近120家。预计全年工业企业研发活动项目350个，研发经费投入6亿元，占全社会研发投入的85%以上，工业企业研发投入主导地位明显。企业创新创业队伍不断壮大，从事科技活动人员近20万人，其中研发人员近3000人；企业科技机构中博士生、研究生、本科生分别为69人、215人、1337人，同比均有大幅增长。
二是工业企业创新基础能力不断提升。加强工业企业创新平台建设，提升工业企业创新基础能力。目前全市建有省级以上工程技术研究中心25个，省级企业技术中心51个，省级工程实验室2家，省级以上创新型试点企业72家，高新技术企业81家，产业技术创新战略联盟5个，院士工作站1个，科技型企业孵化器1个。贝克药业“抗艾滋病药物拉米夫定原料及其系列组合制剂开发”项目获得省科学技术奖一等奖，这也是改革开放以来我市首次获此殊誉。以园区为载体的创新平台加速发展，安徽阜阳国家农业科技园区、太和经开区现代医药产业集聚发展基地、医药高端制剂特色产业基地、界首粮食机械省级高新技术产业基地加快建设。界首田营循环经济产业园新能源(电池)集聚发展基地，阜合现代产业园区光电新材料产业集聚发展基地规划实施。阜阳农业物联网研究院、金太阳先进产业技术研究院建成运行。这些平台在全市工业创新发展中发挥了重要作用。
三是工业结构加速转型升级。传统产业在技术创新升级带动下焕发新的活力。2015年食品、化工、机械电子、再生资源利用、煤电、纺织等支柱产业共实现增加值398.4亿元，占全部规模工业的79.1%，其中食品工业增长2.9%，煤电工业增长4.4%，再生资源利用业、纺织工业分别增长20.8%、15.1%，生物医药产业增长22.2%。装备制造业成为新亮点，其中通用设备制造业增长24.3%；专用设备制造业增长10.7%；电气机械和器材制造业增加值增长18.5%。
四是“两新”产业快速发展。高新技术产业和战略性新兴产业持续稳步快速发展，整体呈现出优势集聚、速度加快、基础夯实、活力增强的良好发展态势，为推进“调、转、促”奠定了坚实基础。2015年全市战略性新兴产业完成产值201亿元，增长34%，增幅位居全省首位；高新技术产业实现产值265.3亿元，增长15.7%，增速居全省第6位。
五是工业发展后劲不断增强。围绕产业技术进步和高新技术主导领域，组织实施了科技创新试点省专项、科技创新与成果转化专项、安徽省重大科技专项、省科技攻关、国家基金建设专项、清洁生产后补助、省企业发展专项等技术升级和改造项目，在中药现代化、新药创制、循环经济、新型材料、煤电化工、装备制造等行业突破和掌握了一批具有自主知识产权的核心技术，为产业发展提供了重要技术支撑。2015年全市工业累计完成投资340亿元，其中，技术改造和升级投资165亿元，增长34.1%。华鑫铅业、天能电池技术升级改造、中能化工、昊源化工合成氨原料路线改造、阜合园区新奕华电子新材料等一批重大项目建成投产，安徽国祯集团生物质循环利用产业园、昊源集团投资煤基新材料、江淮汽车集团专用车底盘及整车制造、金种子生态文化产业园、刘庄煤电一体化、阜南电动科技产业园、太和中科生物基地等重大工业项目加快规划实施，这些项目将为阜阳工业发展注入强大发展后劲。
