为进一步加强我市青少年科技创新活动篷勃开展，激励广大青少年学生积极参加科技创新活动，2005年4月18日，经市政府第28常务会议审议通过，同意设立芜湖市青少年科技创新市长奖。
对在校的中小学生参加“全国青少年科技创新大赛” 、“明天小小科学家”奖励活动获三等奖（含）以上的项目；在英特尔国际科学与工程大奖赛（美国主办）、迈向未来——国际青少年科学大会（俄罗斯主办）、欧盟青少年科学竞赛、国际环境科研项目奥林匹克竞赛（土耳其主办）、国际青少年科学家论坛（英国主办）等国际科学竞赛中获得优异成绩的学生进行表彰奖励。每年评选一次，奖励名额不超过5人，同时对指导学生在参加科技创新活动中获奖的科技辅导员也给予表彰和奖励。
芜湖市青少年科技创新市长奖分别于2006、2007、2008、2009、2010年、2012年召开了六届“市长奖”的颁奖大会，有13名学生、15名辅导教师获得表彰。
