国务院批复中对福厦泉自创区的定位表述是，打造连接海峡两岸、具有较强产业竞争力和国际影响力的科技创新中心。
新获批的两大国家自主创新示范区(自创区)定位敲定。
6月20日，中国政府网发布国务院关于同意合芜蚌国家高新区、福厦泉国家高新区建设国家自主创新示范区的批复。批复指出，合芜蚌地区要打造具有重要影响力的产业创新中心；福厦泉地区要打造连接海峡两岸、具有较强产业竞争力和国际影响力的科技创新中心。
按批复所述，合芜蚌自创区要打造具有重要影响力的产业创新中心，努力把合芜蚌国家高新区建设成为科技体制改革和创新政策先行区、科技成果转化示范区、产业创新升级引领区、大众创新创业生态区。
合芜蚌国家自创区脱胎于合芜蚌自主创新综合试验区，包括合肥国家高新区、芜湖国家高新区以及蚌埠国家高新区。
关于合芜蚌自创区未来的发展方向，安徽省经济研究院总经济师周云峰告诉澎湃，主要倾向于自主创新和创新驱动方面，加快核心竞争力。合肥、芜湖和蚌埠三市通过分工和协作，安徽省内城市也将一些创新资源向合芜蚌地区倾斜，以此带动安徽经济的转型升级。
周云峰介绍，近几年，安徽的战略性新兴产业增长速度在30%左右，特别是电子信息、高端装备制造、现代医药以及新能源新材料等方面发展迅速。合肥的电子信息、芜湖的机器人，以及两地的智能家电，蚌埠的新能源都是安徽的优势和特色。
安徽省发改委相关负责人曾在接受媒体采访时表示，建设合芜蚌国家自创区有利于形成以成都、长株潭、东湖、合芜蚌、苏南、张江等完整区域创新链，实现东中西部互动合作、接续发展、协同发展。
批复中对福厦泉自创区的定位表述是，打造连接海峡两岸、具有较强产业竞争力和国际影响力的科技创新中心，努力把福厦泉国家高新区建设成为科技体制改革和创新政策先行区、海上丝绸之路技术转移核心区、海峡两岸协同创新和产业转型升级示范区。
据今年4月公开的《福建省“十三五”战略性新兴产业发展专项规划》指出，福厦泉国家自创区以福州、厦门、泉州3个国家高新区为核心，以福州、厦门2个国家级创新型试点城市和平潭综合实验区为重点，推动创新资源集聚和高端产业发展，辐射带动闽东南沿海各区域高新技术产业联动发展。
福厦泉自创区围绕福州、厦门和泉州片区的主要功能，打造连接海峡两岸的科技创新中心。
福州片区在两岸深度融合发展、协同创新和创新生态环境等方面提供样板；厦门片区在两岸高端产业集聚发展、推进后工业化进程和创新合作战略性枢纽作用等方面提供示范；泉州片区在汇聚民间资本、调动民营企业活力、创新科技体制机制改革等方面提供示范。
这是今年国家自创区的第二次扩围。算上福厦泉和合芜蚌，今年上半年，国务院已批准设立5个国家自创区，其中，河南郑洛新、山东半岛、辽宁沈大3个自创区是今年3月刚刚设立的。
澎湃新闻发现，各地申报国家自创区热情高涨，同时自创区的数量也呈现加速扩容的趋势，至今获批设立的国家自创区已达到16个。
对此，一位长期研究区域经济的学者对澎湃新闻表示，目前已批复自创区的数量并不算多，经济“新常态”的背景下，从数量扩张到质量提升迈进，中央也提出要推进供给侧改革，都需要提高科技创新的能力。他认为，从省域角度而言，自主创新能力能达到前十名的省份适宜建立2到3个自创区，涵盖省内一半的城市。
中国区域经济协会秘书长陈耀此前对澎湃新闻分析，“自创区可以遍地开花，今后还会越来越多，不会少于国家级新区。”目前，国家级新区已批复17个。今年4月，科技部副部长阴和俊曾表示，科技部将积极推动再建设一批国家自主创新示范区，注重把握“三个突出”：突出创新发展特色；突出“东转西进”布局设想；突出引领示范和辐射带动作用。
